「ファイル」から新規作成のFTPサイトをクリックします。
「登録名」には任意の名前、
「接続先」にはFTPサーバー名、
「ユーザー名」にはFTPログイン名、
「パスワード」にはFTPパスワードを入力し、「OK」ボタンをクリックします。

フォルダツリーで、転送するファイルが保存されているフォルダを選択します。
選択されたフォルダの内容が画面に表示されますので、
「編集」から「コピー」をクリックして転送するファイルをコピーします。

フォルダツリーでFTPの中の登録名を選択し、接続します。
接続すると「www」のフォルダが表示されますので、ダブルクリックします。
ここにファイルを転送しますのでコピーしたファイルを貼り付けします。

まとめて転送をしたい場合は、「編集」から「コピー」ではなく
「編集」から「一括コピー」を選択します。
保存しているフォルダにあるすべてのファイルが一覧で表示されます。
ここで転送したいファイル名にチェックをするとコピーが出来ます。